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親子鑒定原理依據(jù)的是孟德爾遺傳學(xué)。子女的基因型一半來自母親，另一半來自父親。

孟德爾遺傳學(xué)分為分離定律和獨(dú)立分配定律。分離定律：決定生物體遺傳 性狀的一對(duì)等位基因在配子形成時(shí)彼此分 開，分別進(jìn)入一個(gè)配子中；分配定律：當(dāng)兩對(duì)以上的等位基因進(jìn)入一個(gè)配子時(shí)，它們相互之間是獨(dú)立自由組合的，后代基因型是雌配子和雄性配子隨機(jī)受精決定的。應(yīng)用到親子鑒定解釋為：

首先，人二倍體生物，因此每一個(gè)基因座位點(diǎn)都有兩個(gè)數(shù)字，一個(gè)來自母親，另一個(gè)來自父親，相同的兩個(gè)數(shù)字為純合子，不同的兩個(gè)數(shù)字為雜合子。

再者，DNA數(shù)據(jù)，在選取的人類遺傳標(biāo)記的中21位點(diǎn)時(shí)，每一個(gè)基因位點(diǎn)隨機(jī)出現(xiàn)兩個(gè)基因座位的可能是大于45的20次方的，因此DNA確認(rèn)個(gè)體是足以區(qū)分地球上人類個(gè)體（同卵多胞胎數(shù)據(jù)一樣除外）。

最后，在傳代時(shí)，每一個(gè)基因座位點(diǎn)都會(huì)分離出兩個(gè)配子。親代每一個(gè)位點(diǎn)有一個(gè)配子傳給子代。符合遺傳規(guī)律的位點(diǎn)就是大人和小孩子在相同的基因座位點(diǎn)上有一個(gè)數(shù)字是完全相同的。

因此，根據(jù)孟德爾遺傳學(xué)原理，在檢測(cè)DNA，判斷親子關(guān)系時(shí)，是足以確認(rèn)親子關(guān)系的。所以親子鑒定可以應(yīng)用于司法用途，常被作為最科學(xué)最公正最直接科學(xué)證據(jù)證明。

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上海親子鑒定中心來自河北承德的客戶反饋：三家鑒定上海親子鑒定中心幫解讀。

2013年在河北做的親子鑒定，結(jié)果是否定的，懷疑有問題，最后選擇上海三家親子鑒定中心做了DNA，驗(yàn)證為親生。把報(bào)告都拿到上海親子鑒定中心，分析原因。最終知道河北做的那次鑒定和上海三家做的親子鑒定孩子不是同一個(gè)人。原來DNA鑒定的奧秘在于個(gè)人的DNA數(shù)據(jù)是不變的。在遺傳時(shí)也是遵循孟德爾遺傳學(xué)，每一個(gè)基因座位點(diǎn)大人和小孩都是有一個(gè)遺傳數(shù)字是相同的。

上海親子鑒定中心來自上海海淀的客戶反饋：親子鑒定能確認(rèn)親子關(guān)系。都說驗(yàn)DNA可以確認(rèn)孩子是親生。也去做了一下親子鑒定，本身孩子就是親生的，DNA親子鑒定的方法證實(shí)也是生物學(xué)親子關(guān)系。現(xiàn)在的技術(shù)真是科學(xué)。法醫(yī)解讀1：符合遺傳規(guī)律的基因座位點(diǎn)數(shù)字相同位點(diǎn)大人和小孩至少有一個(gè)相同的。親子鑒定報(bào)告看檢測(cè)的后的數(shù)據(jù)分析親子關(guān)系。通常用數(shù)字來表示某個(gè)位點(diǎn)的遺傳密碼，其數(shù)字代表是堿基重復(fù)數(shù)。同一個(gè)基因座位點(diǎn)，親代和子代至少有一個(gè)數(shù)字相同的，代表子代能從親權(quán)找到遺傳的來源，符合遺傳規(guī)律。法醫(yī)解讀2：數(shù)字分析比對(duì)。如基因座位點(diǎn)D19S433大人是（14.2，,15.2），孩子是（14,14.2）則是符合遺傳規(guī)律的，即孩子的14.2能從大人哪里找到相同的數(shù)字14.2；若該位點(diǎn)大人是（13，,15.2），孩子是（14,14.2）則不符合遺傳規(guī)律。