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幾個月后，已經開始博士課程的鄧亞軍重返北京，成為華大基因研究中心執行主任汪建的助手。

這時的華大基因由于在國際人類基因組計劃、水稻基因組計劃等重大課題上為中國科學界做出卓越貢獻，也迎來了一個自身發展的契機一-2002年10月，華大基因研究中心從一個民營企業，被吸納為中國科學院下屬的一家研究機構，即中國科學院北京基因組研究所，楊煥明任所長，汪建任副所長一一這種變化意味著，以后再進行類似國際人類基因組計劃這樣的大型重點項目時，研究中心便會得到國家在財力上強有力的支持，這對一心做學問的科學家來說，無疑是最大的肯定。

2002年11月，在一次出差途中，汪建與鄧亞軍談起了對她未來工作的安排。

當時鄧亞軍做的主要是辦公室行政類的工作，盡管做得很不錯，但在汪建看來，這并不適合她。

此前，華大基因方面已經向國家有關部門申請創辦華大方瑞司法物證鑒定中心，希望利用自身在DNA研究領域的特長，向公眾提供包括親子鑒定在內的服務，同時也可以在司法物證領域發揮應有的作用。在這次出差前，華大方瑞司法物證鑒定中心剛剛通過審批，汪建問鄧亞軍你對這個部門有興趣嗎?