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參加這個項目，讓鄧亞軍一下打開了眼界，開始真正接觸到世界一流的研究技術(shù)和成果，比如自己參與的項目能在《自然》這樣的國際頂級雜志上發(fā)表論文，這就相當(dāng)于運動員在奧運會上拿到金牌，這在以前完全是不可想象的。
然而更大的挑戰(zhàn)還在后面，在國際人類基因組計劃接近完成的同時，楊煥明、汪建等人還把目光投向了中國的超級雜交稻。
當(dāng)時以日本為首的多國代表制訂了國際水稻基因組測序計劃，為充分開發(fā)利用超級雜交稻這一寶貴的國家資源，同時繼續(xù)保持我國在雜交水稻育種領(lǐng)域的國際領(lǐng)先地位，華大方面決定聯(lián)合國家雜交水稻工程技術(shù)研究中心，進行中國超級雜交水稻基因組計劃
鄧亞軍擔(dān)任主管后，負責(zé)的就是為超級雜交稻測序的重要任務(wù)一一當(dāng)時在研究中心，資歷比她深、學(xué)歷比她高的人并不少，而將她提拔到這個崗位的汪建認為:鄧亞軍盡管年輕，但是她勇于承擔(dān)責(zé)任，敢做敢當(dāng)，有很強的正義感，這些品質(zhì)在關(guān)鍵時刻比單純的學(xué)歷、資歷更重要。
由于在國際人類基因組計劃中積累了不少經(jīng)驗，中國的水稻基因組計劃進行得非常順利，畢竟水稻的DNA堿基數(shù)目只是人類的1/150為了完成這個項目，中國方面一共技人了2億元人民幣，而日本牽頭的國際水稻基因組測序計劃到結(jié)束時一算賬，也花了2個億，不過是美金。
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